今年春天，容貌秀麗、完美無缺的優等生司波深雪將進入「魔法科高中」就讀。深雪夢想著和一同入學的哥哥達也過著親密的高中生活，但擋在她面前的是一科生與二科生--優等生與劣等生的高牆……!?由愛慕哥哥之心更勝親情的妹妹深雪的視角所鮮活描繪的另一個「魔法科高中」在此上演。

第2集【請問可以一起嗎】，今年就讀第一高中的光井穗香，在入學測驗當時就對深雪留下深刻印象，暗自決定要和深雪成為好朋友。然而正式入學之後，她體認到一科生與二科生的嚴重隔閡……

第3集【少女偵探團,出動！】，第一高中進入社團招生週，獲選為風紀委員的達也嶄露頭角，卻遭受不明人士的攻擊。穗香與雫得知之後，決定和新認識的艾咪一起暗中調查……

第4集【朋友】，深雪得知反魔法團體"Blanche"滲入第一高中，但達也保證一定會保護兩人的日常生活。另一方面，艾咪等人組織的少女偵探團跟蹤司甲想取得關鍵證據，卻早就被對方看穿行動……

第5集【不會讓你們出手】，Blanche對第一高中發動恐怖攻擊。穗香等人協助風紀委員成功逮捕司一，達也也因為平靜的日常生活被破壞，決定進攻Blanche的根據地。

第6集【九校戰開幕】，九校戰正式開幕，深雪在交誼會認識了第三高中的一色愛梨等人。第一高中在前半賽程維持領先，摩利卻意外在比賽中受傷，深雪被真由美指名代打上陣……

第7集【數式連鎖】，九校戰進入新人賽賽程，雫在精速射擊對上第三高中的十七夜栞。面對栞的拿手魔法「數式連鎖」，雫以達也為她準備的戰術從容應戰。

第8集【冰炎地獄】，新人賽第二天，愛梨在群球搶分獲得冠軍，栞在冰柱攻防的預賽也輕取對手。三高與一高總分逐漸拉近的這個時候，深雪即將在本屆九校戰首次上場……

第9集【因為有妳】，九校戰的新人賽，在冰柱攻防再贏一場就能晉級決賽的艾咪，對手是第三高中的十七夜栞。打進衝浪競速決賽的穗香，則是要和四十九院沓子一決勝負。

第10集【不想輸給妳】，深雪接受雫的挑戰，在冰柱攻防的決賽一較高下。面對雫展現的決心，深雪也決定毫不保留全力應戰。

第11集【哥哥,祝您武運昌隆】，祕碑解碼新人賽的一高選手發生意外，達也受命代打上陣。深雪得知這一連串的意外是蓄意妨害，決定找艾咪等人一起暗中保護達也。

今年春天，容貌秀麗、完美無缺的優等生司波深雪將進入「魔法科高中」就讀。深雪夢想著和一同入學的哥哥達也過著親密的高中生活，但擋在她面前的是一科生與二科生--優等生與劣等生的高牆……!?由愛慕哥哥之心更勝親情的妹妹深雪的視角所鮮活描繪的另一個「魔法科高中」在此上演。