曹操刺殺董卓未遂逃離，董兵窮追不捨，曹操想逃回譙郡和曹家兵匯合，這樣方能保命。譙郡鬥拐場華佗和一幫年輕人正在進行鬥拐比賽，董卓侄子董驃前來搗亂，華佗惡治董驃，讓董驃有苦難言。醫館隊和大栓隊鬥拐，華佗的童養媳惠娘來找華佗回家，路遇明心，一個要華佗回家，一個要華佗陪她玩，面對兩個都愛自己的女人，華佗十分尷尬，一番爭議惠娘只好妥協。

明心送信給華佗，要他和自己明早私奔。華佗找吳成要錢，被惠娘和華父發現，遭到華父嚴厲斥責，華父強行讓華佗和惠娘成親，並讓吳成在外面看守，吳成心痛。明心在家準備明日與華佗私奔，並讓胡半仙幫忙。華佗在新房喝多酒誤把惠娘當明心，並有了肌膚之親，吳成痛苦萬分，回想起小時候惠娘的各種好。明心來華府見華佗已成親，怒火中燒，氣憤而走，華佗緊追。吳成和慧娘去追華佗，巧遇曹操跑進城，華佗幫曹操推城門，兩人結下推門之誼，董兵射箭，吳成為救惠娘，不想一箭射穿了自己和明心。

華佗在縣衙求胡半仙帶信給明心，胡半仙不肯，華佗只好隔牆跟喜蓮對話，請她告訴明心自己住在破廟，吳成給華佗和惠娘送來了被褥用品，明心知道華佗住在破廟，心裡不忍，她雖氣華佗，但內心深處還是念著他。明心思念華佗又不好開口，讓縣令把吳成叫來為自己看病，借勢好打探華佗消息。縣令來到校場發現胡半仙征的兵都是老弱病殘，很不滿意，曹操率領曹家軍驗證操練，以振士氣，縣令覺得很沒面子。

董兵攻城關鍵時刻，曹操親自帶兵殺出城，一場混戰，打退董兵，得勝而歸。譙郡全城群情振奮，歡慶勝利。但勝利中存著隱患，譙郡被圍，糧草囤積有限，外面董兵援軍正在匆匆趕來，最終鹿死誰手很難預料。胡半仙揣摩縣令要想好退路，明心前來鼓勵父親堅決抗董，胡半仙向喜蓮獻花求愛，被喜蓮戲弄，曹操跟華佗帳前促膝長談，兩人加深了情感，另一邊曹仁率人秘密挖地道，以備後路。

董軍叫陣，曹兵不出，夏侯勇再遭曹仁訓斥，華佗發現受傷士兵傷口化膿，心急如焚，想挖去爛肉但沒有麻醉藥，華佗用麻醉藥麻醉自己，要惠娘拿針紮他做實驗，想儘快研製出麻醉藥。華佗發現傷兵傷口潰爛，要挖肉，傷兵不肯，最後病死，華佗回家找華父要麻醉藥，父親認為麻醉藥還在研製期，不能亂用，但後來被華佗的誠意和思想感動決定與其一同前往救治，華佗欲用麻醉藥給大栓開刀，被縣令認為是瞎胡鬧。

胡半仙在明心的暗中幫助下，找到吳成。叫吳成晚上快去河邊救華佗，吳成救起醉酒差點淹死的華佗，問華佗是怎麼回事，華佗說出縣令和夏侯勇串通欲叛敵的事，吳成勸華佗別管這事，但華佗不聽，一定要趕快告訴曹操，這不僅關係到曹操，如城門洞開，董兵殺進來，也關係到全城百姓的安危。惠娘看見華佗的木屐沿河飄來，猜出華佗出事，將華佗丟到河裡的兩個衙役完事後向縣令彙報華佗已死，胡半仙得知後告訴明心，明心大驚悲傷，痛不欲生，連忙和喜蓮到河邊來找。

第三次大規模攻城又開始了 ，董軍越來越強，差點攻破城門，多虧華佗及華父帶領全城百姓誓死支援，才擊退董兵。經過上次華佗的大難不死，明心對華佗的愛再次公開明朗起來，明心甚至親自來破廟裡來探望華佗，華佗和明心情真意切，相互傾訴，讓惠娘和吳成很難堪，而吳成不合時宜的說出惠娘已懷有身孕，華佗給惠娘一搭脈，果真如此，華佗大驚失色。

吳成借酒對惠娘表達愛意，被惠娘堅決抵制，華佗帶著投降信來到縣衙跟縣令對峙，縣令不承認，曹操來了，綁了縣令全家，胡半仙和喜蓮回到縣衙，發現縣衙已被抄，並與曹兵廝打起來，沒想到喜蓮被打暈，胡半仙怒火中燒，打暈曹兵，把喜蓮藏在麻袋扛到城門口，用縣衙官印打開城門，不料城門剛打開，埋伏在城外的董兵蜂擁而入，董兵抓起胡半仙的麻袋就走，胡半仙只得往回追。縣令一家被綁縛在在縣衙院子裡，曹操斥責縣令叛變投敵，還當場殺了單眼皮士兵，說投降信就是他為縣令送的，華佗暗暗吃驚，自己的計謀中可沒有殺人一說啊，但又不可明說。

縣令見明心身體減弱，想叫吳成來給明心看病，吳成診斷明心都是因為心悶憂鬱而成疾。並幫縣令也把了脈。晚上華佗還是主動和惠娘分床而睡，惠娘無奈，這邊華佗精心照料身懷有孕的惠娘，而吳成常給明心看病也漸漸熟熱起來，不料縣令病倒，吳成卻對此無力，只好請來師傅華父來看。華佗在給百姓看病時得知戰後傷殘撫恤金至今未發，很多窮人貧病交加，苦日難捱，華佗怒火中燒，自縛雙手，帶著傷兵大鬧縣衙討說法。

明心得知惠娘去世，內心很自責，是她拖住華佗不讓其回家，拖延了時間才使惠娘耽誤了治療，不幸去世，覺得對此負有責任，愧疚不已。胡半仙在喜蓮的逼問下，抖出了自己是為了喜蓮而貪污撫恤金，喜蓮恨鐵不成鋼，告訴明心和縣令，胡半仙被縣令逐出縣衙。華佗、吳成悲痛哀悼惠娘，明心帶喜蓮來弔唁惠娘，被華佗轟出，明心傷心昏死過去。

吳成來到廚房為明心端藥，可他卻偷偷地在明心的藥中加入了另外一味藥，喜蓮多次看見他這么做。這天，喜蓮看見他在下藥，就詢問他這是什麼藥，他自己找理由糊弄了過去。可是，在緊張之中，一顆藥丸不慎掉下。喜蓮撿到了那顆藥丸，她帶著藥丸去找胡半仙詢問胡半仙這是什麼藥，胡半仙看到這顆藥，發現這居然是九轉丹。胡半仙為了自己能夠參選上太醫以後就可以娶喜蓮而沒有將事情真相告訴喜蓮，希望用這個藥丸威脅吳成讓他退賽。胡半仙拿著九轉丹找到吳成讓他退出，否則就讓他東窗事發，吳成不知道如何是好。

華佗為牛二看腰病，他精湛的醫術正好被甄太醫看到，甄太醫對這種怪才很喜歡，他將這個事告訴了縣令，可縣令卻不建議華佗，他向甄太醫推薦吳成，可甄太醫早就知道縣令女兒明心與吳成的關係，於是，他提出進行一場終選，有心的吳成在門外聽到了這一切。甄太醫看到華佗用一種叫麻醉藥的東西為病人治療，對他的麻醉藥很有興趣，對他的關注度也很高，可華佗對於甄太醫這個高官並不畏懼。而吳成見甄太醫對華佗這么感興趣心生記恨。吳成看到甄太醫既然這么器重華佗，那么他要當上太醫的事情就會受到威脅，於是，他就想借用胡半仙將華佗給弄下去，他故意在胡半仙面前講華佗的不是。

吳成當上了太醫，明心自然很高興，可是，吳成卻要立馬動身去京城當職了。吳成坐上馬車離開的時候，華佗追上他交代他要小心，吳成趁機讓華佗照顧明心，以此來報復他自己心愛的人在面前卻不能靠近的滋味。吳成離開之後，明心每日都在思念他，兩個人也經常有書信往來，一天，明心突然眼疾病復發暈了過去。為了治療明心的眼疾，縣令讓華佗帶著明心趕往京城去太醫院治病，華佗只好帶著明心上路。在去往京城的路上，他們救下一對被官兵追捕的母子，從他們口中，華佗得知馬五鎮守城常將軍因為夫人生病無藥可醫，遇到一名天師，天師告訴他只要用童男童女祭神就可以醫治夫人的病，將軍聽從天師的話正在滿城抓童男童女。

買包子時不料被太醫院醫丞甄大人妹妹甄依柳看中，甄妹妹對吳成一見鍾情，每天親自上門給吳成送包子，被吳成婉言拒絕。可甄妹妹三番幾次找吳成，吳成懷疑她就是甄大人的親妹妹，私下通過賈太醫證實了身份，吳成心中已明白一二，可礙於明心的面，一直拒絕甄妹妹。明心開始對這個無論在長相和人品上都無法與自己相比的胖女人並不在意，可面對她不停的騷擾，明心慢慢有些不安和煩躁，要吳成要守住自己，吳成在明心面前發誓，今生今世只愛明心一人。

明心此刻滿腹的委屈和憤懣一起撒在華佗身上，怒罵華佗多管閒事，不僅害了她治病，還會耽誤了吳成的仕途功名，華佗無語。江大人的夫人領著江大人來大鬧太醫院，說是太醫院讓江湖草醫華佗治壞了江大人，那天華佗為了顯功力給江大人腎病扎針，雖當時見效，卻治標不治本，加上沒有後續跟進治療，江大人的腎病越發嚴重，江夫人鬧得太醫院不得安寧，最後吳成出面，認真醫治才使江大人病有好轉。曹丞相頭瘋病發，通知太醫院醫生速到丞相府商量給曹操看病，可吳成卻被甄大人禁止前往，排擠留在院中。

吳成去酒館戒酒消愁，想起了惠娘，對華佗也更加憎恨。回到家中從明心口中得知華佗已走，一想覺得華佗這麼走了對自己不好，關鍵還沒有學會華佗的針刺麻醉之法，於是忙在半路上截回華佗。華佗念著他們師兄弟之情，也為吳成將來能在太醫院多一門技術，華佗藉練針法知名，故意將針灸麻醉手法交給吳成。華佗來到太醫院請賈太醫替明心治眼疾，甄大人礙於他和曹操的關係又不敢拒絕，但不刁難一下華佗心裡又不服氣，故意讓劉太醫去醫治，華佗不從，膽小謹慎的賈太醫不敢得罪甄大人，萬般推脫，華佗無奈只得讓劉太醫前往。

自從華佗給曹操治療頭風病之後，曹操的頭疼雖然好多了，但是他卻經常感到疲乏無力想要入睡，華佗判定他是整日忙碌而至。甄妹妹在家中裝病求哥哥叫吳成到甄府治病，甄大人不答應，可經不住甄妹妹的一再糾纏，只得命人叫來吳成，此刻吳成已存高攀之心，正中下懷，殷情的匆匆趕來為甄妹妹看病，甄妹妹很是享受，甄大人可沒那麼簡單，等吳成看完病就將他趕走，不讓他與甄妹妹有獨處私聊的機會，甄妹妹又不高興了，質問甄大人這是為何，甄大人說這叫欲擒故縱。

華佗見曹操殺人如麻，趕到丞相府要見曹操理論，卻遭到守門將士阻攔，曹操早知華佗會來鬧事，故讓士兵將其擋在門外。華佗卻在門外大罵曹操殘忍，大聲揭短，把曹操陳年嗅事都抖落出來，曹操無奈，只得讓他進來。兩人免不了又一番針鋒相對，各說各理，話不投機，華佗憤然離開。深夜吳成帶著禮品拜見甄大人，向其道歉賠禮，宣誓效忠，甄大人勸吳成識時務投入甄家，吳成屈服，暗下決心娶甄妹妹，以此靠著女人往上爬。

明心生日的這一天，兩條裙子做好了，吳成給明心送去了一條，明心很開心，接著他又拿著裙子找甄依柳送給了她，甄依柳卻堅持留他一起吃飯，吳成沒辦法只好照做。在吃飯的時候，甄依柳將合歡散倒到了酒壺中，吳成就這樣成為了甄依柳的人。吳成終於回到了家，在門口正好碰到華佗，華佗警告他不要做什麼對不起明心的事兒，吳成將自己去見甄依柳的事情說了出來，在門裡面的明心聽到了這一切。明心質問吳成去哪，吳成藉口有自己的事，跟賈太醫在一起，可賈太醫一直就在吳成家和華佗在一起，吳成見謊話被揭穿，吳成見事已至此，乾脆把話挑明瞭，說自己要跟甄妹妹成親，眾人聽後大為驚詫，華佗和明心更是怒不可遏。

明心從京城回來之後，整天以淚洗面，不願意進食。華佗見狀很擔心明心的身體，於是，他想到一個辦法。一個叫雲兒的丫鬟也是剛從京城回來，她來找喜蓮說話，兩個人在一起說起吳成為了仕途和甄依柳成親的事情，這時，縣令走過來非常氣憤，並一下子吐出一口血來，明心聽聞父親生病很擔心，就將華佗給請了回來。華佗告訴明心縣令不能再受刺激，明心為了父親的性命，就答應父親從今以後不會再為吳成傷心，一定會好好吃飯，縣令才開心了起來。而其實，縣令吐得那口血是華佗事先給他準備好的豬血，為的就是讓明心重新振作起來。

胡半仙偷偷來到華佗住處盜取華佗的麻醉藥配方，並派人送給吳成，而吳成並沒有交給甄大人，而是按其配方做成藥研究一下，搞清楚了效果再交給甄大人。不曾想甄家下人錯把麻醉藥當成保胎藥給甄妹妹吃下，導致甄妹妹失血流產，而且還永遠失去了生育能力。甄家一陣大亂，吳成後悔不已，心中更加恨華佗，甄太醫怒斥吳成，逼得吳成不得不說出實情，是自己暗藏麻醉藥無意中害了她。甄大人恨不得殺了他，在甄妹妹的磕頭求情下，才勉強放過吳成。

最終甄大人還是受到曹操的任用，主持官藥採辦之職，甄大人派吳成及兒子小甄去採辦貢藥。吳成領命出發之前求甄大人允許他納明心為妾，說是自己亦無父母，因甄妹妹不能生育，不想再無後，甄大人勉強同意。華佗在家用豬試驗麻藥，記錄麻藥的時間和藥性，胡半仙來告訴他吳成將回來奉旨採辦貢藥。華佗不以為然。吳成回到譙郡，縣令卻不待見他，但他公務在身，縣令又不得不配合。吳成榮歸故里，來華家醫館拜見師傅，眾師兄弟們甚是羨慕，風光一時，吳成趁機抬著聘禮一行人來到縣衙向縣令提親想納明心為妾，遭到縣令和明心的斥責，明心和華佗當眾揭穿吳成的無恥行徑，嬉笑怒罵，搞得吳成很沒面子，草草收場。

吳成並不是不想收這些銀子，他是覺得銀子太少，另外他覺得這件事有華佗插手，事情就沒那麼簡單了，他必須要找好時機。牛二又去賄賂華佗，被華佗當眾戲弄，牛二不死心，設宴款待華佗，華佗如約而至，卻帶來了一大幫窮苦難民一起吃飯，搞得牛二措手不及，白花了一大筆銀兩。吳成指使牛二利用華勝來陷害華佗，他們把好藥都集中供給華勝，華佗驗過藥後覺得華勝的藥品為上乘合格藥材，將華勝定位貢藥供應商。

華陀為父守靈，明心前來弔唁，華佗告訴明心此事蹊蹺，要縣令好好查查。吳成帶著貢藥回京，與甄大人心照不宣，哪曾想貢藥和次藥入庫時被士兵把弄反了，次藥放在外面，而把好藥放在裡面。吳成回到家裡心中惴惴不安，原來他的秘密被師父發現，師父要去告發他，他沒想到吳成會變成這種人，吳成請求師父原諒他，兩人一直邊走邊說到山頂上，吳成拖住師父，兩人在拉扯中，華父不慎失足落入懸崖，被吳成拉住，但就這樣華父還是不肯原諒吳成，吳成此刻鬆手，讓華父跌落山澗。

為了救吳成和兒子，甄太醫知道曹操最看中的就是忠心，於是，他決定向曹操承認這件事他是主謀，甄太醫劍走偏鋒，終於救下吳成他們。自從華佗救了胡半仙的命之後，胡半仙就痛改前非，他找到吳成求他想辦法放了縣令他們，可吳成卻不願意出手相助，胡半仙只好拿出他與牛二之間的帳簿威脅吳成，可吳成還是不為所動。胡半仙只好拿著帳簿找華佗，華佗看到帳簿就想告倒吳成，他來到監獄將此事告訴華勝和縣令，並讓華勝出來作證，華勝為了贖罪，答應了。華佗剛離開，甄太醫就來到了獄中。

華佗帶著明心等人一起回到了譙郡，因為縣衙已經不是明心的家了，華佗就帶著她回到自己家，他們是四個人從此就這樣一起生活。因為明心一直處在悲傷的情緒當中，她的眼睛突然失明完全看不見了，華佗為明心治療，但是他卻束手無策，不過他向明心保證自己會一直守候在她的身邊保護她。明心讓華佗離開，並將他從頭到尾的諷刺一遍，說他是個無用的男人，雖然明心這麼說，華佗很傷心，但是他依然選擇留下她的身邊保護她。而明心之所以這麼說，她是覺得自己配不上華佗，不想再連累華佗。

爺爺見華佗身懷一顆救治百姓的善心，對他很是欣賞，而靈兒在與華佗的朝夕相處中，對他居然動情了。而華佗在這個意外桃源中，學習到了很多醫術。華佗雖然遠在外界，可他卻會時不時地書信給明心他們，而明心他們這裡也過的很是平靜，胡半仙坐診養活明心他們，沸兒也長大入了學。因為沸兒沒有父親，被其他的小孩子欺負並被罵為小野種，沸兒聽此很生氣就和他們打了起來，明心知道了這件事之後，難過地哭了起來。這天，明心和喜蓮帶著沸兒在街上逛街的時候卻正好碰到前來為惠娘上香的吳成，不過，喜蓮看到他就立馬帶著明心離開了。

華佗和靈兒帶著這位男子逃走了，可沒想到的是這位男子居然是天來，華佗見天來吃了那麼多的苦，就讓他以後都跟著自己。周瑜兩軍對峙於長江南北兩岸，華佗和靈兒來到吳國，並揭榜治好了周瑜的病，他們住在周瑜府內，靈兒向天來說起自己的身世，從獵戶老母親口中得知，靈兒可能是個將軍與大戶小姐的私生女。只是失散後被山裡隱居老爺爺收養了。曹營突發瘟疫，華佗聽說曹營得瘟疫，華佗想回江北曹營，周瑜卻不讓，並想法困住華佗。江北曹營裡，曹操責令吳成短期內務必治癒瘟疫，無奈吳成無法在短期內治癒曹營瘟疫，但提議將屍體推向江中順流而下，讓其病毒感染東吳士兵也死于瘟疫，被曹操斥責。

天來和靈兒逃亡中，摔下懸崖，天來和靈兒從水中爬起來，在山裡找了個破廟暫時安身，天來生火為其取暖，並親自上山採藥。華佗明心一家人吃飯其樂融融，華佗下決心要把明心的眼睛治好，吳成回瞧郡給惠娘祭拜時無意在街上聽到沸兒喊明心為娘，頓起疑心，吳成追問，明心不理，喜蓮趕來，吳成問喜蓮，卻被喜蓮一番訓斥，無奈吳成宴請胡半仙，想從他口中套出今日明心的孩子之來歷，卻被胡半仙戲弄一番。

吳成一頓花言巧語後，天來被吳成帶去京城並誆騙天來留在京城，就可以借機殺掉曹操，為其家人報仇。但其真正用意就是想把天來獻給曹操邀功，華佗和明心在家佈置家中準備拜堂成親，突然聽胡半仙說吳成帶走了天來，華陀帶著靈兒立即奔赴京城尋找天來，吳成譙郡認子之事被甄妹妹和甄大人知道，遭到甄家兄妹一頓斥責，並告知吳成，除非自己死了，否則就別想把沸兒那個野種帶進甄家，吳成突想一計，不送天來去曹操邀功，而是將天來送給甄大人，從而利用天來刺殺曹操來連累甄大人，華佗和靈兒從瞧郡一路來到京城，來到甄家找到吳成讓其交出天來，吳成抵賴否認見過天來，無奈華佗靈兒只好離開。

華佗在家為研製麻醉藥，親自嘗試，不料藥性過量發作，華佗臨終前寫下遺書，華佗試藥而亡，明心曹操等人悲傷至極，曹丕命令吳成給曹沖治病只能治標，不能治本，並承諾吳成待自己稱王時不會虧待吳成，吳成在家與甄家父子商量對策，甄大人勸其抱住曹丕這自己則打算去曹沖那裡搞好關係，靈堂之上吳成藉給華佗祭拜，實質想帶走沸兒，眾人對吳成一番訓斥，甄妹妹大鬧靈堂，對明心一頓謾罵指責，被趕來祭拜華佗的曹操給震住。曹沖病危，曹操只好讓吳成為其治療，吳成請胡半仙喝酒，其中逼問胡半仙，沸兒的來歷，並承諾如果沸兒真的是自己的骨肉，自己將會好好的善待明心母子倆。

靈兒坦露自己愛天來，明心理解，突然華佗死而復生，原來是自己試麻醉藥過量，假死了七天，大家喜出望外，明心、華佗相擁而泣。曹操得知華佗死而復生，親自請華佗替曹沖看病並要求他親自負責曹沖的配藥，華佗安排胡半仙、靈兒、喜蓮輔助做藥醫治，此時曹丕要吳成尋機下手下毒害死曹沖，吳成害怕，吳成去找華佗看望曹沖病情，卻被拒之門外，無從下手的吳成又受到曹丕的催促，於是心生一計找到喜蓮說曹丕要對華佗身邊的明心下手，要喜蓮快帶明心離開，這樣華佗自然就走了，喜蓮不信，但後幾天喜蓮發現有人跟蹤她，急忙去找吳成，吳成面授機宜，喜蓮趁胡半仙不備，往曹沖藥裡摻藥。

甄太醫死之後，甄太醫的職位就由吳成來接手，吳成剛當上太醫院的醫丞，就將甄府換成了吳府。吳成來到客棧接沸兒回去，甄依柳見哥哥屍骨未寒，吳成就來歡天喜地的來接兒子，很生氣，於是她和吳成打鬧了起來，甄依柳沒有了甄太醫的依賴，吳成對她是肆無忌憚，狠狠地將她打倒在地，並告訴她她的哥哥就是被他害死的。吳成鬧著要將沸兒帶走，華佗聽到聲音趕了出來將吳成給趕走了，可是沸兒為了以後不再受人欺負，想要和吳成這個威風的爹離開，吳成聽此喜笑顏開，可卻被華佗攆走了。

靈兒面見曹操，並於曹操相認，曹操大喜，不料此時天來突然殺進來舉劍刺殺曹操，眼看曹操就要中劍，靈兒突然用自己的身體擋住劍峰救了曹操，自己卻被天來的劍刺中，天來與曹操大悲，最後靈兒在曹操懷中死去。靈兒死前要求曹操放過天來，曹操答應，曹操帶天來來到密室，告訴其中秘密，原來曹操心中一直有愧呂家，故派人澆築呂家三口泥像，每天對著銅像下跪懺悔，並告訴天來，在以後的日子裡讓天來做自己的監斬官，以後若自己違背諾言，坑害百姓，可以隨時隨地殺了他。

曹操到前線，天來手握寶劍立在曹操身邊監視著他，眾將官很不服氣，夏侯勇擋下天來不讓進帳，反遭曹操訓斥。吳成為了沸兒來到瞧郡，要把明心和沸兒接回去，被明心堅決拒絕，沸兒想跟去，明心嚴厲斥責，沸兒嚇哭了，明心心軟。曹軍中，曹將對曹操保護天來頗有微詞，大家議論紛紛。華佗四處看病，民不聊生，戰亂禍起，可不是醫生看得了的，華佗對曹操說拯救民眾是你們這些政客的責任，不要到處挑起戰火，百姓才能安居樂業，可曹操不以為然。譙郡傭人張媽在明心面前鼓噪，說華佗不好，整天在外面也不管他們娘倆，這樣的男人怎麼靠啊，說的明心更加思念華佗了。

因下大雨，吳成找到破廟發現沸兒已經生病，明心無計可施，焦急萬分，吳成藉此帶著明心和沸兒去京城。傳消息關羽已死，曹營上下震動，華佗、天來更是悲憤難抑，天來想起小時候關羽對自己的好，不禁淚如雨下，他向華佗道出了自己心裡的苦悶，對曹操自己不知是殺還是留，他介乎于英雄和魔鬼之間，有時看他對百姓很好，有時又殺人不眨眼，自己不知該怎麼辦？關羽的軍隊撤走，曹操進入關羽的軍營，曹操命手下保護好關羽的靈帳，誰也不許打擾。

關羽聽說天來之死，一個人單刀赴會，獨闖曹營為天來扶棺送行，曹操知道關羽必來，早就為其準備好了白衣，曹操、華佗、關羽三人為天來送行，也因為天來他們最後一次相聚在一起。祭奠後華佗、曹操關羽三人分道揚鑣，華佗代表百姓向他們這些英雄下跪，告誡他們血洗的江山終究會被血洗。明心跟吳成到京城，還是不住吳成府，只住在外面客棧。吳成命令甄妹妹去求明心來吳府住，沸兒也求明心，明心只好答應。在吳成家，甄妹妹地位每況愈下，吳成處處侮辱她，打她，可明心同情她，最後兩人變成了同病相憐的好友。

沸兒無意中說出了昨晚之事，吳成痛打甄妹妹，並使用酷刑，用火烙她，明心前來阻止，甄妹妹的慘叫和眼前的情景把沸兒嚇暈過去，明心帶著沸兒連夜逃走，卻被吳成抓回，擄走沸兒，把明心甩出大門外，沸兒吵著要娘，吳成不耐煩，命人將他關了起來，甄妹妹和娟兒想辦法救出沸兒，將沸兒送出大門交給明心，讓她們娘兒倆趕快逃走。吳成發現沸兒不在了，知道是甄妹妹將其放走了，又將甄妹妹一頓暴打，並用頭簪戳瞎了甄妹妹的雙眼，把甄妹妹趕了出去，最終流浪街頭。

牛二總覺得自己肚子裡有地蠍子，家裡、床上、地上、桌上到處都是，忙找華佗為自己看病，華佗教育他以後要多多行善積德，少做壞事，你把從孩子手上騙去的大宅子物歸原主就行了，牛二只得乖乖讓出房子。華佗，明心和沸兒喜氣洋洋的搬進了自己的家，華佗幫牛二治好了病，牛二良心發現，來華佗家懺悔，向華佗坦白自己用蛐蛐“黑頭將軍”強行向明心、沸兒索賠華家醫館的事，全是由吳成一手策劃和教唆的，不料此事讓沸兒聽到，受到強烈的刺激，撲倒明心懷裡大哭起來，他沒想到吳成是這麼壞的一個人，在華佗耐心哄勸和開導下，沸兒漸漸平靜了下來，似乎一夜之間長大了不少。

但為了搞清藥物對身體麻醉劑量標準，華佗痛苦地要求明心允許他解剖沸兒的身體，明心經過艱難的抉擇，最終還是深明大義同意了。吳成從京城趕來，大鬧沸兒靈堂，歇斯底里找華佗和明心算帳，關鍵時刻，牛二帶領鄉親們挺身而出，制止了吳成的無理取鬧。吳成見百姓人多勢眾，不便久留，要把沸兒的遺體帶回去，華佗不答應，吳成最後只得咬牙切齒的離開。華佗將沸兒靈位列入華家祠堂，作為華家子孫以供憑弔。

此刻遠在京城的曹操頭痛病發，宮中太醫亦無良策，曹操派人速來瞧郡請華佗前去治病，華佗為了明心推脫，說等明心過幾天手術痊癒了再去京城。曹操聽說華佗不來，大為惱火，但他深知華佗脾氣，也無可奈何，此刻吳成趁機挑撥，鼓動曹操再次派人將華佗綁進京，華佗只好帶著明心一同前往。華佗被迫來到京城為曹操看病，他將明心安頓在旅店裡，自己來到丞相府，看到曹操頭痛欲裂，難以自持，針刺麻醉已不起作用，華佗建議用麻沸散麻醉後為曹操做開顱手術，各位大臣和現場太醫們驚得瞠目結舌，認為這簡直是瞎胡鬧，吳成和曹丕認為華佗是不懷好意，想害死曹操，曹操將信將疑。

關鍵時刻，吳成到大牢有意將自己一生所做的惡事統統道出，他要讓華佗帶著痛苦和遺憾死去，他要發洩畸形變態的壓抑心理，一解心頭之恨。曹操的頭風病更厲害了，疼痛難忍之下更是氣急敗壞的叫嚷要殺了華佗，曹丕正好就勢替父宣召：“殺了華佗！”曹操從病痛中緩緩醒來，忽然看見那天被試藥砍手的侍衛站於一邊，死而復生，知道自己錯怪了華佗，忙命人把華佗放出來，可曹丕說華佗已經遵父命被殺了，曹操大怒，要懲罰曹丕，這時復仇的小甄跳出來把所有罪過都推到吳成身上，說丕公子所有的壞事都是有吳成在背後指使的。曹操為了掩蓋家醜，殺一儆百，命將吳成綁縛刑場就地正法。