在古代墨西哥繁盛一時的太陽的子民阿茲特克，他們流傳著一枚奇妙的「石鬼面」。那是一枚奇蹟的面具，能讓人擁有一種力量，能獲得永遠的生命並成為真正的掌控者。然而從某個時候開始，就從歷史中消失了蹤影。時光飛逝，來到了19世紀後葉。在這個人們的思想與生活產生激烈變化的時代，喬納森．喬斯達與迪奧．布朗度二人相遇。二人一同渡過了少年時代到青年時代，最後因為「石鬼面」，而步上了奇特詭譎的命運──。

第2話【來自過去的一封信】喬納森與迪奧升上大學，迪奧正式成為喬斯達家的養子，而他想霸佔喬斯達家的計劃也持續在進行，他的目標是毒殺喬斯達爵士。另一方面，喬納森偶然發現布朗度的信，開始懷疑父親身體逐漸衰弱是因為中毒，為了查明真相，他決定前往倫敦。迪奧知道這件事之後，為了暗中守護他的祕密，決定利用喬納斯正在研究的神祕面具「石鬼面」。

第3話【與迪奧一同渡過的青春年少】強納森成功取得解藥，回到喬斯達家大宅。喬納森揭發迪奧的惡行，並質問他，迪奧態度良好地表示他有在反省。然而，出身黑暗街區的男人史比特瓦根很肯定地喬納森說：「這小子是天生的壞肧子。」要他小心迪奧。迪奧被逼入絕境，自己帶上了石鬼面，決定「超越人類」。於是，渴望鮮血而變得極為狂暴的迪奧，伸出魔爪襲擊喬納森……！

第4話【波紋疾走】與迪奧一戰之後，身受重傷的喬納森與艾莉娜重逢，艾莉娜寸步不離的照顧他，讓他身心的傷勢都日漸恢復。某一天，喬納森前去查探發生慘劇的宅邸廢墟，雖然沒有找到石鬼面讓他覺得很擔心，但他還是想要遺忘那件事。然而，在回家的路上，他遇到了一名自稱齊柏林的男人，使他的命運再度大幅轉動。另一方面，一名坐著輪椅的男子，出現在讓整個倫敦陷入恐懼的殺人魔「開膛手傑克」面前，那名男子竟是原應死在喬家大宅的迪奧……！

第5話【暗黑的騎士們】「風之騎士鎮」是一座被險峻斷崖包圍的小鎮。喬納森一行人來到了小鎮的郊外，遇到了一個少年扒手波克，最後終於見到了迪奧本人。面對展現出殘暴帝王的氣勢的迪奧，齊貝林與喬納林不斷使出波紋攻擊，但波紋能量全都被迪奧用氣化冷凍的方式封住了。迪奧更進一步地召喚已成為活屍的傳說騎士塔卡斯與布拉霍，發動猛烈的攻擊。

第6話【明日的勇氣】喬納森與布拉霍的生死決鬥繼續，布拉霍從兩人的戰鬥中察覺到喬納森勇者的資質，因而要求彼此盡最大的力量戰鬥。兩人生死決鬥的結果，布拉霍藉由喬納森的波紋取回了身為人類的痛覺與高潔的靈魂，他將「幸運與勇氣之劍」交託給喬納森之後即消滅。喬納森等人對迪奧更加感到憤怒的同時，塔卡斯的劍正向他們發動攻擊。他們一行人逃進古代騎士們用來作為修練場的遺跡之中，但是…？

第7話【承繼者】喬納森被抓進了雙頭龍之廳，因為波克奮勇的行動，通往雙頭龍之廳的門打開了。齊貝林立刻前去解救喬納森，但他腦中想到的卻是以往他師父多配地告訴他的「死亡命運」！正如那命運所示，齊貝林的身體在塔卡斯的必殺技能攻擊下，斷成了兩半。然而，他憑自己的意志使出了終極波紋「深仙脈疾走」，讓瀕死的喬納森擁有嶄新的力量。喬維森因為波紋能量互相加乘的效果變得更強大，並展開充滿憤怒與悲傷的反擊……！

第8話【血戰！JOJO&ampampDIO】脫離修練場之後，喬納森一行人與齊貝林的師父多配地以及他的徒弟們會合，但鎮民不斷變成活屍，讓喬納森感到相當焦急。另一方面，等著用活屍壓制他們的迪奧，正在引誘波克的姊姊成為自己的同伴，但他卻受到無情的拒絕，於是他命令怪人杜比攻擊她，但喬納森出手拯救她脫離險境。喬納森再度面對迪奧，他胸中懷抱著對許多人的思念，帶著「幸運與勇氣之劍」與迪奧決戰！

第9話【最後的波紋】迪奧與喬納森之間的恩怨糾纏終於畫下了句點。結束了這場生死決鬥，喬納森與為他獻上一切、支持者他的心愛女人──艾莉娜結婚了。他們搭乘前往美國的蒸汽船前去渡蜜月，兩人談論著小時候的回憶，享受這幸福一刻。但那時候，喬納森卻看到了原本應該已被打倒的，迪奧的手下王鐘……！在感到震驚的同時，喬納森追著他來到了輪機室，結果卻看到……！

第10話【紐約的JOJO】1938年，美國──。在已故祖父的知已好友史比根瓦特的邀請下，喬瑟夫・喬斯達與祖母艾莉娜一起從倫敦來到了紐約。喬瑟夫一抵達立刻被牽扯進一場糾紛當中，稍稍展露了他與生具來的波紋之力與尊貴血統的一鱗半角。另一方面，正在調查一座遺跡的史比根瓦特，遭到與他同行的史特雷所背叛……！史特雷告訴瀕死的史比根瓦特，他對石鬼面與永生不死的渴望。

第11話【遊戲高手】變成吸血鬼的史特雷出現在喬瑟夫面前的是！雖然喬瑟夫制敵機先的用機關槍掃射，但對方卻完全沒有受傷，這讓喬瑟夫感到毛骨悚然。相對的，史特雷打算用必殺技一擊斬殺喬瑟夫，卻出乎意料地遭到喬瑟夫用機智的計策反擊。「波紋法」的繼承人史特雷已變成怪物，甚至用手榴彈炸成灰也他能復原，對面這樣的敵人，喬瑟夫只剩下唯一的一個方法能對付他！而那精心準備的方法是……？

第12話【柱之男】為了調查史特雷所留下的訊息「柱之男」的祕密，喬瑟夫一路前往墨西歌。在當地聽到史比特瓦根還存活的好消息，不由得感到非常高興。另一方面，在囚禁史比特瓦根的地下實驗室裡，德軍正在研究「柱之男」。他們在實驗中，將石之男從石柱分離下來，將其命名為「桑坦那」。在那之後，力量強大到能將石鬼面之男吸收掉的桑坦那，開始更加快速地成長……。

第13話【JOJO vs 終極生物】喬瑟夫終於來到墨西哥的地下研究所，見到了「柱之男桑坦那」，彼此開始進入戰鬥。然而，喬瑟夫的波紋能量被桑坦那的身體反彈出來，無法從外部攻擊他。這時，喬瑟夫想到一個苦肉計，打算從桑坦那的體內直接使用波紋。不過，桑坦那的力量遠遠凌駕於吸血鬼之上，對他來說，喬瑟夫的波紋並不足以致命，他以令人驚異的速度開始恢復……！？

第14話【來自遠古的終極戰士】除了桑坦那以外，也還有其在「柱之男」存在──。喬瑟夫知道這件事情之後，遵照修特羅哈姆的遺言，與史比特瓦根一起飛往羅馬。而在那裡等待他的是威爾‧Ａ‧齊貝林的孫子西撒。可能是感情直接的喬瑟夫與愛裝模作樣西撒八字不合，兩人反目成仇。他們就在彼此嫌惡的情況下，前去德軍發現的「柱之男」所在之地。另一方面，地下遺跡「柱之男」正要從長眠中甦醒……！

第15話【英雄的資格】西撒的朋友被復活的「柱之男」──瓦姆烏、艾特西、卡茲三人所殺，他極為震怒。雖然他使出了有萬全準備的必殺技「連環泡沫彈」，卻被瓦姆烏用專門對付波紋的金屬繩，輕易地擊破了。他們「柱之男」在與二千年前就已存在的「波紋一族」的戰鬥中，早已學會了怎樣對付波紋。西撒束手無策地站在一傍，相對地，喬瑟夫展露一手斬新的必殺技，挑戰瓦姆烏等人。

第16話【波紋師父莉莎莉莎】喬瑟夫的心臟與喉嚨被掛上了「毒戒指」，作為再戰的誓約。他必須在33天之內戰勝瓦姆烏與艾特西，否則就無法脫離戒指的詛咒束縛。然而，西撒知道以他們現在的實力打不贏瓦姆烏，他決定與喬瑟夫一起去造訪住在威尼斯的波紋高手。那位高手是一位名叫莉莎莉莎的妙齡美女。喬瑟夫一開始看不起她的實力，最後親身體驗到她的強大，並藉著一個月的嚴格修練，努力讓自己更加成長！

第17話【設下極深的陷阱】莉莎莉莎給喬瑟夫一個最後的考驗，那就是戰勝羅吉茲師父。然而，當他來到試練場之後，等待他的不是羅吉茲而是「柱之男」艾西特。艾西特知道他們在找的「恩嘉紅寶石」在莉莎莉莎手上，因而對他們發動了攻擊。喬瑟夫對這預料之外的發展感到震驚，但為了阻止艾西特，他仍是展開了反擊。喬瑟夫的波紋已經有長足進步，但那在艾西特面前能發揮功效嗎……？

第18話【修特羅哈姆隊的反擊】喬瑟夫戰勝艾西特之後，前去尋找莉莎莉莎準備向她報告這個情況。在那裡，卻看到女傭人絲吉Q正打算襲擊莉莎莉莎。喬瑟夫知道原本應該已經被他打倒的艾西特附在絲吉Q身上，於是結合西撒的技能一起消滅艾西特。但艾西特已經將「恩嘉紅寶石」送過去給同伴了。知道紅寶石被送往瑞士的聖莫里茨之後，喬瑟夫等人，急忙追了過去！

第19話【衝向死亡懸崖】原本應該在桑坦那之戰中化為灰塵的德國軍人修特羅哈姆，出現在「紅寶石」送達的地點。已全身機械化的修特羅哈姆與現身想要謀奪「恩嘉紅寶石」的卡茲開始戰鬥。兩人展開了超越凡人的戰鬥，但使用「光之流法」的卡茲壓制了修特羅哈姆。喬瑟夫看著他們展開生死決鬥，並親眼目賭卡茲掉落的「紅寶石」在雪上滑向了懸崖，他為了拿回「紅寶石」而開始在雪上狂衝……！

第20話【西撒孤獨的年少時光】西撒隱密的過去──，那也是發生在西撒父親馬利歐身上的悲劇故事。西撒想要洗刷齊貝林一族長年累積的仇恨，為了打倒殺父仇人卡茲，他單獨闖入了敵人的據點。在出現在那裡的並不是卡茲，而是使用「風之流法」的瓦姆烏。肩負齊貝林一族的榮耀，西撒開始與瓦姆烏交手。西撒與喬瑟夫一起經歷了嚴刻的訓練，他威力大增的波紋在瓦姆烏身上炸裂！

第21話【一百對二的討價還價】沒有時間哀悼西撒的死亡，喬瑟夫與莉莎莉莎出發前往卡茲與瓦姆烏在等待的房間。那裡除了卡茲他們以外，還有多達一百隻的吸血鬼嚴陣以待。面對這壓倒性強大的敵人數量，喬瑟夫顯得極為焦躁，但莉莎莉莎賭上了「恩嘉紅寶石」，對卡茲提議決鬥。卡茲等人接受她的提議，並指定決鬥的時間與地點。滿月之夜，在名為「骸骨的腳跟石」的古代環狀盤石場來一場不死不休的決鬥……？

第22話【真正的格鬥者】在環狀盤石競技場，喬瑟夫對瓦姆烏的戰車之戰終於展開！喬瑟夫用各種小技倆超越了瓦姆烏，成功拿到第一回合的武器大鐵鎚。高興沒多久，卡茲口中號稱「戰鬥天才」的瓦姆烏就用比喬瑟夫更高明的方法迎擊。喬瑟夫在瓦姆烏出人意料的反擊下，被揮下戰車變得毫無防備。在這千鈞一髮的情況下，喬瑟夫採取了什麼樣的行動？

第23話【化為風的戰士】喬瑟夫與瓦姆烏的生死決鬥，在雙方一步不讓的情況下，喬瑟夫逐漸佔上風。在喬瑟夫聰明的計策下，受到致命一擊的瓦姆烏，使出了最後的殺手鐗──最終流法「渾楔颯」。然而，喬瑟夫反過來利用那攻擊，從瓦姆烏手中獲得了勝利。喬瑟夫達成了他對西撒的誓言，當場吞下了「毒戒指」的解藥。接下來，剩下莉莎莉莎與卡茲的一戰──。他們一行人前往下一個決鬥場「畢茲貝路利那山神殿遺跡」。

第24話【與JOJO的深厚連結】卡茲以瀕死的莉莎莉莎為誘餌，打算將喬瑟夫逼到身心俱疲的絕境。然而，比起被騙喬瑟夫更擅長騙人，他用不斷使出絕妙的奇策，以竭盡全力的波紋攻擊，打倒了卡茲。這時，榮耀戰士們的戰鬥，終於迎向了結尾。看著喬瑟夫拼命守護莉莎莉莎的強悍模樣，史比特瓦根靜靜地說出他們的過往。那是跟莉莎莉莎與喬瑟夫有關的，一個悲傷離奇的命運的故事──。

第25話【超級生物的誕生】卡茲利用「恩嘉紅寶石」中的石鬼面之力順利復活，變成不怕太陽的「終極生命體」，這樣的卡茲已是無敵的狀態。喬瑟夫等人感覺到壓倒性的實力差距，開始拼命逃亡，而在逃亡當中發現了德軍的戰鬥機。喬瑟夫很快的坐進戰鬥機內之後，為了與糾纏不休的卡茲對抗，他而開始執行賭上性命的奇襲計劃。面對不怕任何技能與武器、永生不死的終極生物，他有何種起死回生的計劃呢……？

第26話【成為神的男人】卡茲在喬瑟夫的攻擊下，落入岩漿之中。但即使如此，卡茲仍是再度復活了，喬瑟夫被砍下了手臂，發出絕望的吶喊。喬瑟夫抱著必死的決心，在卡茲對他發動致命一擊的那一瞬間，他手上的「恩嘉紅寶石」增強了波紋能量，武爾卡諾島的火山開始噴發。強大到甚至噴出大氣圈外的岩漿將喬瑟夫與卡茲吞沒……？跨越好幾世代的恩怨情仇，在此了結！