2025年，TOKYO MER過往的實績獲得肯定，TOKYO MER的首席醫師喜多見，以及護理師夏梅，則以指導人員身分派駐南海MER，投入醫療資源不足的離島醫療工作。某天，鹿兒島縣諏訪之瀨島突然發生大規模火山爆發，熔岩吞沒村落，四處飛散的巨大噴石接連破壞道路與建築物。在近乎絕望的情況下，為了救出被困在島上的79名居民，南海MER展開了一場賭上性命的艱鉅任務。
