由獅王帶領的眾動物們已經待在諾亞方舟上數個月，他們在海上漂流尋找著陸地；擔任方舟大廚的戴夫因船上的糧食快要用盡，緊張的焦頭爛額，就怕動物們沒吃飽，開始自相殘殺，動物們似乎也感受到這樣的氣氛而躁動了起來…。另一方面，戴夫的兒子菲尼與好朋友莉亞總是喜歡在船上調皮搗蛋，把整艘船搞得雞飛狗跳，被父母懲罰禁足的兩人，意外發現方舟上的糧食就快要沒了，正當他們還在驚訝之際，突如其來的意外讓兩人失足落水，無法回到方舟上的他們漂流到一個神祕的島嶼，發現一群動物已經在這裡定居已久，而島上的這些動物並不是很歡迎他們的到來，一場冒險之旅即將展開…。