五次元人邪惡帝國攻擊了地球。自古代守護地球的光之戰士，藍光人在戰鬥中落敗，掉到了地上陽昇小學的五年三班。藍光人將操縱雷神王的雷神徽章和雷神指揮器託付給學生，請他們保護地球後就消失了。

突然間被藍光人請託防衛地球任務的五年三班學生們。劍王的駕駛員日向仁興致滿滿！但膽小的星山吼兒卻無法隱藏不安。防衛隊的長官要求交出雷神王時，從垃圾中誕生的邪惡獸廢品怪出現了！

考試拿到零分的仁，在篠田老師的命令下，由飛鳥、瑪莉亞、吼兒和勉四個人教他讀書。但討厭讀書的仁心有不滿，產生了邪惡獸考試怪。在隔天考試時考試怪出現了，考試攻擊朝向開心出擊的仁襲捲而來。

在登山遠足的途中，吼兒和名為山口梢的少女在寬廣的花園相遇了。吼兒從梢那邊聽說，山上的自然環境正因為土地開發漸漸消失。同時，仁等人也和梢的哥哥實起了衝突，誕生出邪惡獸切割怪。邪惡獸切割怪開始砍伐起森林。

仁雖然前往社團日拳法社的跑步活動，但他卻先到了陽昇寺，因為其實寺廟牆壁的洞裡藏了考砸的考卷。但是出現了打算縱火的流氓，拯救危機的是矢澤校長的必殺技「龍尾腳」，仁在那之後就深深的迷上龍尾腳。

織江救了差點被車撞到的飛鳥，但織江卻因此受傷了。對瑪莉亞說出的「交通事故真是困擾」，讓邪惡球產生反應誕生出邪惡獸事故怪。事故怪讓失控的卡車出現在陽昇町引發交通事故，仁等人也開始進行巡邏。

邪惡球對「醉漢真是讓人困擾」這句話產生反應。邪惡獸出現在防衛組的成員之一，時惠雙親經營的居酒屋「陽昇亭」。防衛組雖然出動了，但無法抓住既小又敏捷的邪惡獸。還因為邪惡獸喝下酒後噴火，使陽昇亭被燒到半毀。

五年三班正在為了才藝發表會練習，但內向的優沒有辦法好好地說出台詞。瑪莉亞等人雖想了個辦法，但反而讓優失去了自信，在表演當天逃走了。就在這時候邪惡獸毒噪音出現了，但是因為負責合體的優不在，大家沒有辦法合體為雷神王。

梅雨的季節。為了努力打掃水溝的男生，瑪莉亞等人為他們做了飯糰。但是，因為「黴菌是社會的困擾」這句話，誕生出了邪惡獸並吃掉了飯糰。瑪莉亞以外的女生們，都認為是仁偷吃的，導致了男生和女生決裂的大爭執。

因為邪惡獸動了手腳，汽油從陽昇鎮消失了。馬路成為了遊樂場，孩子們都興奮不已。但是家中經營加油站的玲子，卻獨自露出了難過的表情。玲子的雙親正考慮著要搬家，五年三班得知後便開始試圖尋找汽油。

暱稱餅乾的栗木容子是班上最矮的，總是寶貴地帶著小熊的娃娃。因為在健康檢查被發育良好的綺羅嘲笑，便哭著跑走了。綺羅雖然道歉了，但不經意地說出「小熊的玩偶真讓人困擾」，導致玩偶變成了邪惡獸！

到了今年泳池開放的時候，秀則因為以前溺水的經歷，而變得害怕水。看不下去的仁和吼兒，便開始在澡堂為他進行特訓。但因為秀則說出「夏天真是讓人困擾」而誕生出了邪惡獸。氣溫變得異常的高，市民泳池、水管和水壩都變成了熱水，鎮上陷入了混亂。

社會科共同研究的期限就在明天，仁、飛鳥和吼兒聚在佐藤大介的家努力中。但是因為大介的父親出差，母親又在住院，仁等人對大介弟妹的惡作劇攻擊感到十分頭痛。在這個時候，佐藤家的小嬰兒三久郎，被貝爾澤布的手下五次元人泰達擄走了！

打預防針當天，因為仁討厭打針讓老師相當困擾。被五年二班的谷口六郎瞧不起的五年三班，賭上地球防衛組的名譽進行棒球比賽。此時因為仁說出「打針真是困擾」產生了邪惡獸好痛喔，但仁卻害怕針筒形狀的邪惡獸。

以一流中學為目標的飛鳥，為了進入絕對合格補習班，連休息的時間都在讀書。就在此時，因為飛機事故真是困擾而出現了邪惡獸。雖然仁等人出擊了，但飛鳥正在補習班考試的途中，仁等人讓飛來飛去的邪惡獸逃走了。

校內躲避球對抗大賽就在後天，為了連球都接不好的運動白癡美紀，體育股長愛子進行了特訓。但美紀覺得太嚴格而認為是在欺負她。接著主力選手瑪莉亞和綺羅則原因不明的發燒倒下了！

雖說明天開始就是暑假，但篠田老師擔心因為地球防衛組的任務而耽擱了學習進度，宣布要在暑假進行特別課程。仁等人表達了反對，瑪莉亞也表示「這是單方面的困擾」。邪惡球對此產生了反應，和篠田老師一模一樣的邪惡獸野蠻地在鎮上開始大鬧。

暑假中瑪莉亞招集了地球防衛組。因為一年級的津波洋一和瑪莉亞的鄰居倉林彩，想要更加了解防衛組的活躍事蹟，由勉介紹防衛組的全貌。但在介紹將要結束時，雷神指揮器出現了沒見過的機體剪影。

海濱學校開始了，小孩們正享受著開心的時光。仁和綽號小明的小川吉明，討論著明天要去東邊海岸的洞窟。但是舉行海濱學校的大波海岸出現了邪惡獸。都是因為邪惡球對篠田老師說的「弄髒海邊真讓人困擾」產生了反應。

因為「銀行強盜真是困擾」這句話而出現了邪惡獸保險櫃。真正的銀行強盜因為佩服他出色的襲擊，而成為了泰達的同伴。銀行強盜奉承著泰達，被慫恿的泰達爽快地讓他們加入，泰達指揮的強盜團就此誕生了！

因為征服地球一直沒有進展，華沙強化了貝爾澤布要他親自戰鬥。另一方面，防衛隊長官來到了地球防衛組，說雷神王大鬧了糖果工廠，毫無印象的防衛組提出了抗議……。

暑假的最後一天，勉和瑪莉亞在校舍內調查。雷神指揮器在四處都出現了疑似新機體的反應。調查途中地球防衛組收到了出動命令。在高速公路上出現了邪惡獸，地球防衛組如往常般出動，但這次貝爾澤布準備了密策……。

地球防衛組的成員都沉迷於從指揮室操縱的新機體爆龍王。但仁因為主角的位置被搶走而不覺得有趣。看見那樣的仁，瑪莉亞突然間怒火中燒。原來是因為附身到人身上，讓人變得易怒的邪惡獸生氣怪附身到了瑪莉亞身上。

有小狗迷路來到了陽昇小學，瑪莉亞將他取名為小尾巴，由五年三班飼養。由擔任飼育股長的美紀負責照顧，但她其實很害怕狗，因為小時候曾有被大狗追過的陰影。但小尾巴卻很黏著美紀……。

陽昇鎮發生了一百億金塊強盜事件，搭乘直升機逃走的犯人被颱風捲入，墜落在了井草山。因為犯人說出「颱風真是困擾」而出現了邪惡獸。同時，最重要的金塊依然下落不明。夢想成為新聞主播的綺羅，把仁捲入一起前往了井草山！

吼兒收到了來自非洲筆友的信，對方是因為幽浮而認識的雷奧尼。雷奧尼是動物保護官的兒子，對最近盜獵者造成的損害感到心痛。同時，防衛組也收到了邪惡獸的情報，獵人邪惡獸吸塵怪出現在了非洲……。

今天是防災演練的日子，但仁和明一點也不認真做。就在此時發生了真正的地震，因為搖晃非常劇烈，明變得恐慌了起來。原來明很害怕地震，明為了逞強就把錯怪到邪惡獸身上……。

五年三班為了明天的運動會努力練習。但組隊參加不倒翁比賽的綺羅和秀則卻不斷失敗。綺羅在此時不禁發怒說出「不倒翁什麼的真是困擾」。邪惡球對其產生反應，邪惡獸不倒翁怪出現了，不倒翁在鎮上四處大鬧！

仁的堂弟日向陽太郎來到了陽昇學圓，陽太郎是雷神王的大粉絲，很憧憬著擔任駕駛員的仁。隔天，因為「亂丟菸蒂真是困擾」出現了邪惡菸頭怪，仁想著要讓陽太郎看見帥氣的一面，就單獨駕駛劍王出擊了。

泉優的妹妹琉璃子很討厭蔬菜。優雖然根據姬木老師的建議，對蔬菜進行了調味……但就在某一天，琉璃子的面前出現了幫她吃掉蔬菜的小小生物。那居然是因為琉璃子說出「蔬菜真是讓人困擾」而出現的邪惡獸蔬菜怪！

電視兒童小明正和爸爸搶電視，媽媽看到之後怒氣便爆發了。邪惡球對「電視真是讓人困擾」這句話產生反應，邪惡獸電視怪誕生了。泰達用邪惡獸的力量讓自己出現在電視上，打算用假消息讓地球陷入混亂。

五年三班聽聞了附近鬼屋的傳言，便決定進行探險。但進入了鬼屋的仁等人，發現了椅子在亂跳，小明被廁所沖走，接二連三的神秘現象襲擊而來。其實這個房子是因為「鬼屋真是讓人困擾」這句話而誕生的邪惡獸鬼屋怪！

明天就是陽昇祭了，但篠田老師因為得知姬木老師要去相親而情緒低落。五年三班決定進行妨礙相親的作戰，用假電話將在相親的時間的兩人叫到公園，但被篠田老師拆穿而失敗了。此時，邪惡獸跳舞怪在鎮上出現，強制讓人們開始跳舞了。

真白山滑雪場因為暴雪封鎖，預定和家裡一起去滑學的飛鳥大失所望，便和嘲笑他的仁吵了起來。隔天醒來之後，仁發現陽昇鎮變得一片雪白，那是因為飛鳥說出「暴風雪真是讓人困擾」，而出現的邪惡獸冷凍怪的鬼。

小明的爺爺是想讓破爛飛機飛起來的飛機愛好者，他發下豪語「才沒有把雷神王放在眼裡」。被激怒的小明脫口說出自己是雷神王的駕駛。小明擅自帶走了雷神指揮器，在爺爺的面前招喚了劍王。

陽昇鎮出現了新的正義的伙伴，歐賽凱薩！他的真實身分是因為「多管閒事的正義的伙伴真是困擾」這句話而誕生的邪惡獸。但歐賽凱薩的強烈正義感廣受小孩子的歡迎。演變成要和雷神王對決誰才是真正的正義伙伴！

仁被發現和小孩子一起在塗鴉，防衛組便被命令清理鎮上的塗鴉。但瑪莉亞有個充滿回憶的塗鴉，那是小時和和爸爸在高架橋下畫的自畫像。瑪莉亞悄悄的留下塗鴉，但鎮上的塗鴉被邪惡獸實體化在到處破壞！

貝爾澤布開始尋找雷神王的基地，法爾澤布降到地上追著雷神王，但被雷神王的風壓吹走而迷路了。同時在陽昇小學，仁因為有了超能力造成大騷動。但其實都是法爾澤布搞的鬼。

為了迎接新年， 仁家裡開的酒舖非常的忙，仁也在店裡幫忙。新年邪惡獸剛塔出現在了準備過年熱鬧的鎮上。地球防衛組雖然出動了，但這個邪惡獸只會把人和東西放在傘上轉，沒有要破壞的跡象。最後只能暫時觀察情形……。

陽昇鎮過年時非常的熱鬧，防衛組的成員一起去溜冰放鬆一下。另一方面，因為尋找雷神王毫無進展而大發雷霆的貝爾澤布，終於決定開始自己搜索。來到地上的被爾澤布，撞見了談論雷神王的小明等人。他便馬上開始進行追蹤……。

貝爾澤布知道了操縱雷神王的是小孩子，便命令泰達去綁架防衛組的成員。泰達偽裝成老婆婆接近餅乾，但吼兒卻剛好經過，泰達只好將兩人一同綁架。同時邪惡獸蟑螂怪在鎮上開始大鬧。

貝爾澤布發現雷神王的基地就在陽昇鎮附近，在城鎮的上空試圖尋找雷神王出擊的瞬間。同時，地球防衛組也在進行掩飾作戰。在鎮上散布煙霧，打算隱藏雷神王出動的瞬間……。

為了明天的健康檢查，在意身高不高的玲子和餅乾扳著一張臉。試著量了身高後餅乾居然長高了2公分！深受打擊的玲子在晚上向神明祈禱能長高。過了一個晚上，玲子的身高就變得和大人一樣高了！？

上次被巨大玲子打倒的貝爾澤布，這次做出了把東西變小的邪惡獸，預定把雷神王縮小後打倒，但因為失誤連自己駕駛的邪惡魔王都變小了！而且兩台機器人都飛到拉麵裡面，被篠田老師吃了下去……。

電視台想要將地球防衛組做成節目。仁他們聽說節目要向全世界播出，便拼命地協助取材，一一公開雷神王的秘密。同時，貝爾澤布也為了檢討為什麼贏不過地球防衛組，回顧了之前的戰鬥……。

泰達觸怒了貝爾澤布被趕出要塞，下定決心要成為地球人。到處尋找工作後，最後找到的是日向酒鋪！？泰達認真地工作，仁的雙親非常中意他。但仁從吼兒那邊聽說了五次元人的特徵，發現了泰達的真面目……。

多虧了仁的功勞，防衛組知道了邪惡獸的秘密，開始尋找邪惡球。雖然找到了一個，但被防衛組的長官強行帶走了。在運輸邪惡球的途中，長官脫口說出「小孩真是讓人困擾」，便出現了邪惡獸柯特摩斯基，鎮上的大人都被變成了小孩！

陽昇鎮總動員尋找邪惡球，蒐集了像山一樣高的邪惡球。說出邪惡球秘密的泰達感受到責任感，來到了地球上。但泰達在地球上已經變成名人，成為被到處追捕的五次元人。

邪惡帝國開始對地球進行總攻擊，使用了巨大的要塞將陽昇鎮從地上拉了起來。雖然地球防衛組出動了，但雷神能量快速地消耗。在邪惡空間內無法發揮雷神王本來的力量！就在此時，升級的超級邪惡魔王出現了……。

失去能量、傷痕累累的劍王們束手無策。貝爾澤布進言應該由自己給防衛組最後一擊，但他反而招致華沙的不悅，華沙決定親自收拾邪惡魔王。同時，在指揮室的瑪莉亞等人發現了讓雷神王復活的方法。

雖打倒了皇帝華沙，但邪惡魔王和神聖雷神王的死鬥還在持續。仁雖然呼喊著沒必要再戰鬥了，但貝爾澤布賭上了戰士的榮耀要打倒雷神王。戰鬥的地點來到了要塞內部，陷入劣勢的貝爾澤布使出了最後的攻擊！就在此時，升級的超級邪惡魔王出現了……。