目標將會是誰！？超危險的真相即將揭開！！第一發狙擊劃破天際！ 柯南與少年偵探團來到堪稱日本第一高的BELL TREE塔(標高635公尺)，正當他們在瞭望台觀賞絕佳美景時，突然看見遠處出現一道閃光…。下一個瞬間，一枚子彈便貫穿了玻璃窗，射中一名男子的胸口！就連ＦＢＩ也被擺了一道！與謎樣的狙擊手展開追逐戰！居然是從那麼遠的距離射擊…，難道是他們！」柯南與女高中生偵探-世良真純尾隨嫌犯所騎乘的摩托車，展開了一場激烈的街頭追逐，但由於嫌犯拋擲手榴彈導致警車接連不斷的爆炸，情況極度危急。這時候，FBI探員茱蒂等人緊急趕至現場，雖然及時解救了身陷險境的柯南與世良，然而嫌犯卻早已跳入海中不見蹤影。