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第1話(免費看)【黎明的朝會 之段】：對忍者來說，迅速得知自己是否具有好運是件重要的事情。於是學園長，為所有忍蛋們舉辦了「追趕跑跳試運馬拉松比賽」。

第2話【來商量的圭子 之段】：新兵衛的妹妹圭子來忍術學園找新兵衛商量事情。因為最近新兵衛在堺的老家福富屋，因為沒有海產送來而傷透腦筋。

第3話【妖怪濡女子 之段】：不讓人接近隱藏了石火箭的城堡，還有共潛者的真面目也都查出來了！那是之前曾為了搶走兵庫水軍的大安宅船設計圖的焦土菇忍者。

第4話【校外教學通知 之段】：十天前發出的校外教學通知，一年丙班的忍蛋都沒人看到。行政人員的小松田，說他貼在大家都看得到的地方，可是…

第5話【毒竹的生存遊戲 之段】：開始正統的生存遊戲訓練的毒竹忍者隊。若只是普通的生存遊戲那太無趣了。於是做了”要一面逃離敵人”的設定再進行訓練！

第6話【遭到淘汰的霜鬼 之段】：忍蛋們的社團活動與毒竹忍者的生存遊戲訓練，在同一個地方進行。大部分的毒竹忍者因為捲入忍蛋的社團活動，結果都遭到淘汰。

第7話【學園長的家庭訪問 之段】：忍術學園休假的時候，忍蛋們全都回家去了，黑木黑木跟食堂大嬸出門泡溫泉。覺得無聊的學園長想到自己可以到忍蛋們的家裡做家庭訪問。

第8話【白石忍者賞花 之段】：好戰的白石忍者們很可能假裝舉行賞花的宴會，背地裡是在進行開戰的準備。於是在宴會會場調查他們準備到什麼程度…

第9話【鑄刀 之段】：自稱劍豪的花房牧之介說什麼都想立刻得到一把刀。因為牧之介的刀從中間斷掉，讓他覺得非常遜。

第10話【友人的曾孫 之段】：忍術學園來了未來的忍者老師「師蛋」。師蛋他將在一年丙班擔任實習老師…

第11話【敵人在哪裡 之段】：實習老師突庵為了保護小松田而成為誘餌。但後來進而演變成忍蛋們得保護突庵。可是，突庵根本就沒有忍者的才能。於是，一年丙班的忍蛋只好保護突庵免於遭到毒網代的攻擊！

第12話【友美的指揮安排 之段】：在毒竹忍術教室等著的，只有毒蛋四人而已。而毒竹忍者隊全體都去員工旅遊了。

第13話【我們是優等生 之段】：亂太郎他們上週跟本週都要接受補考。但替他們打分數的土井老師卻胃痛了起來。因為平常總是不及格的三人居然考了滿分。

第14話【成為教師之道 之段】：身為”師蛋”的北石照代與突庵望太來忍術學園應徵曬忍術道具的兼職人員。他們打算一面打工一面找機會成為忍術學園的教師…

第15話【圖書室的人 之段】：新兵衛的妹妹圭子來到忍術學園。圭子其實是來見她崇拜的那個人「中在家學長」。

第16話【釣到的男人 之段】：準備在海裡釣魚的亂太郎他們，想不到釣上來的不是魚，而是平日愛做壞事的板井野飛田。聽過他為什麼會落海的原因之後…

第20話【午後的共同課程 之段】：今天下午的課是山田老師與土井老師的共同課程。將決定要上山田老師的實習課程，或是在教室由土井老師上課。而霧丸卻打了某個主意。

第21話【毒竹的預演 之段】：隨時都想跟別人開戰的毒竹，似乎又在計畫要攻擊忍術學園。要是不阻止毒竹的計畫，將會有嚴重的事情發生！

第22話【古老的鉦 之段】：據說有個來自中國且稀有的鉦，聽了它的聲音就會讓人不知不覺想跳舞。新兵衛的爸爸得到這個鉦，並打算讓它收藏在金樂寺裡…

第23話【商人中在家 之段】：圭子暗戀的是六年級的中在家學長。想不到平常能獨當一面的圭子，只要扯到中在家學長的事情就整個人陷進去還努力過頭。擔心的新兵衛爸爸決定前往忍術學園，偷偷觀察中在家學長是個什麼樣的人…

第24話【守護馬鈴薯燉肉 之段】：毒竹忍術教室今天的課程是偷吃忍術學園的食堂大嬸做的美味馬鈴薯燉肉！

第25話【北石照代的煩惱 之段】：北石照代夢想成為忍術學園的老師。她也是實戰經驗豐富的女忍者，大家也對她抱持高度的期待，不過…

第26話【神秘的教學觀摩日 之段】：在忍術學園如果忍蛋的監護人是忍者的話，為了讓他們看到忍蛋們在校充滿活力的一面，會幫他們安排在不現身的情況下在一旁觀摩忍蛋上課的情形。今天是亂太郎的爸爸跟媽媽來到忍術學園。