第1集【亂糟糟的單車之旅!男生的秘密】，小竹和森川、飯塚兄弟約好騎單車上富士山，小魔女們不放心決定偷偷跟著他們。旅程的前半店雖然很順利，但是在中途由於擔任隊長的小竹忘了帶錢包，竟然沒錢買煮晚餐的材料，讓大家很不滿，也讓小竹覺得很愧疚。於是小魔女們決定伸出援手，變身成大姊姊做烤肉給他們吃，DoReMi和小竹的聊天也讓小竹領悟到擔任隊長的責任並非只是帶大家到達目的地而已，讓大家玩得開心也是很重要的責任，因此掃除了心裡的陰影，完成了這趟單車之旅。

第2集【紐約的魔法堂!小桃子的秘密】，小桃子和音符正好都有機會去紐約，小桃子很開心可以有機會去看看老朋友貝絲和貝絲的新朋友幸子。她帶音符去了紐約的魔法堂，音為魔法堂還沒有新的主人，她們就借用了那裡製作了小桃子最喜歡的布朗尼餅乾，小桃子還告訴音符一個關於布朗尼的小故事。魔女夢露敎小桃子製作的布朗尼餅乾，曾經在學校舉行的園遊會裡賣出最好的成績，但是小桃子也是在這時無意間發現了魔女夢露是魔女的秘密，因此讓魔女夢露變成了魔女青蛙。

第3集【游泳的價值!小愛的秘密】，一班和二班要舉行班際游泳比賽，小愛為了激勵同學們的士氣，隱瞞自己不會游泳的事情，硬著頭皮接下來接力賽最後一棒的重任。可是不管她怎麼努力練習都學不會游泳，雖然在泳技精湛的羽月特訓之下，總算能游完十公尺，可是最後一棒必須游完五十公尺，最後小愛終於放棄參賽，請羽月擔任最後一棒的重任。沒想到原來領先的羽月卻在最後關頭腳抽筋，二班因此輸掉了比賽，同學們雖然傷心，但是關老師提醒之後，大家終於想通了游泳比賽最重要的並不是輸贏，而是大家的友誼和健康。

第4集【不要標準模式!音符的秘密】，音符突然對自己感到迷惑，對於過去覺得快樂的事情，突然覺得不快樂；不知道自己的方向在哪裡。於是決定翹一天班，獨自一個人跑回自己小時候住的小鎮思考，當她看見過去熟悉的景色好像顯得不太一樣的時候，才領悟到原來沒有什麼東西是永遠不會改變的，是她自己改變了。這並不是結束，而是一個全新的自我出現了。於是她決定忠於自己的意志，選擇了一個配角的腳色來挑戰。

第5集【懂得眼淚的人!泡泡和小花的秘密】，泡泡總是被人當成懂事的孩子，她看到小花的天真無邪，不由對小花說真想變成小花的樣子，結果小花真的用魔法把她們倆的身分對調了過來。結果泡泡變成小花所以不會說話，而小花卻變成泡泡在學校裡鬧翻天，泡泡怕小花在學校裡毀了她的一世英明，決定無論如何都要想辦法把身份換回來才行，於是引發了一場大混亂…

第6集【金平糖的回憶!管家婆婆的秘密】，管家婆婆自從在舞蹈教室看見羽月跳芭蕾舞之後，就好像怪怪的，而且還躲起來偷偷哭泣。羽月決定找出管家婆婆的秘密，原來管家婆婆小時候曾經喜歡過一位名叫溫彥的男孩，他們兩一起度過了美好的時光，一起欣賞”胡桃鉗”的芭蕾舞劇，可是戰爭開始後他們就分開了，從軍的溫彥從此再也沒有回來過，羽月覺得管家婆婆好可憐，可是婆婆說上了年紀以後會把傷心的往事都忘記，只會把快樂的事情留在記憶裡。

第7集【最愛鯛魚燒 父子的秘密】，描述升上五年級的小魔女們在暑假假期前後，發生的校園生活趣事，並在假期中認識許多新的朋友，在這一連串的驚喜與突發奇想的事件中，小魔女們每一位成員都得到許許多多生活新體驗，在彼此的關心與同心協力下，更加深了小魔女們之間的友誼，而小魔女們因此有了他們之間共同的許多小小秘密……

第8集【笛子事件 資優生的秘密】，描述升上五年級的小魔女們在暑假假期前後，發生的校園生活趣事，並在假期中認識許多新的朋友，在這一連串的驚喜與突發奇想的事件中，小魔女們每一位成員都得到許許多多生活新體驗，在彼此的關心與同心協力下，更加深了小魔女們之間的友誼，而小魔女們因此有了他們之間共同的許多小小秘密……

第9集【活力充沛棒球社 魔女們的秘密】，描述升上五年級的小魔女們在暑假假期前後，發生的校園生活趣事，並在假期中認識許多新的朋友，在這一連串的驚喜與突發奇想的事件中，小魔女們每一位成員都得到許許多多生活新體驗，在彼此的關心與同心協力下，更加深了小魔女們之間的友誼，而小魔女們因此有了他們之間共同的許多小小秘密……

第10集【結婚的約定 青梅竹馬的秘密】，描述升上五年級的小魔女們在暑假假期前後，發生的校園生活趣事，並在假期中認識許多新的朋友，在這一連串的驚喜與突發奇想的事件中，小魔女們每一位成員都得到許許多多生活新體驗，在彼此的關心與同心協力下，更加深了小魔女們之間的友誼，而小魔女們因此有了他們之間共同的許多小小秘密……

第11集【西洋情人節 羽月的秘密】，描述升上五年級的小魔女們在暑假假期前後，發生的校園生活趣事，並在假期中認識許多新的朋友，在這一連串的驚喜與突發奇想的事件中，小魔女們每一位成員都得到許許多多生活新體驗，在彼此的關心與同心協力下，更加深了小魔女們之間的友誼，而小魔女們因此有了他們之間共同的許多小小秘密……

第12集【第七個魔女見習生 小望的秘密】，描述升上五年級的小魔女們在暑假假期前後，發生的校園生活趣事，並在假期中認識許多新的朋友，在這一連串的驚喜與突發奇想的事件中，小魔女們每一位成員都得到許許多多生活新體驗，在彼此的關心與同心協力下，更加深了小魔女們之間的友誼，而小魔女們因此有了他們之間共同的許多小小秘密…….

第13集【穿越時空的女兒節娃娃 DoReMi的秘密】，描述升上五年級的小魔女們在暑假假期前後，發生的校園生活趣事，並在假期中認識許多新的朋友，在這一連串的驚喜與突發奇想的事件中，小魔女們每一位成員都得到許許多多生活新體驗，在彼此的關心與同心協力下，更加深了小魔女們之間的友誼，而小魔女們因此有了他們之間共同的許多小小秘密……