第1話【機密事項一零一 藍色修羅花】，明治六十四年，東京市。經營古書店的店主．雪村，是秘密抹殺反政府組織成員的「鵺」夜的行刑人之一。雪村和「鵺」的同伴月城以及花風一起，受命殲滅企圖在東京城竣工慶典上暗殺慶喜的反體制派組織首領．蛇野目。月城和花風潛入慶典尋找線索，而雪村則在地道埋伏。 野獸異形。以藍血之力變身的雪村與之對峙。

第2話【機密事項零三三 金庫看守】，被盜名冊中的德川政府要員們逐個被殺。認為鵺中出現了叛徒的仁命令月城搜查叛徒，並派雪村和花風護衛金庫看守．恭子。逃離過程中，雪村得知了發生在自己的故鄉．鴉森的滅族事件的真相就在恭子腦中。另一方面，月城出現在雪村不在的古書店，將某種藥交給了淺陽。

第3話【機密事項六一四 害群之馬】，下令殺害金庫看守的人是仁，這同時也是慶喜的旨意。看著心情鬱悶的雪村，月城暗示復仇會令淺陽遭遇危險，並建議雪村與她分開。內心動搖的雪村於是暗下決心。與此同時，月城查出叛徒是清掃人。雪村．月城．花風三人約見清掃人。

故事背景設在明治 64 年，並由德川慶喜掌握權力的另一個日本。國家靠能量源「龍脈」，形成江戶和科學混合的獨特發展。但繁華背後，反體制派組織「蛇」正醞釀革命之火。德川政府委任闇組織「鵺」將其驅除。雪村咲羽在幼時被滅門，於是她作為「鵺」的處刑人，為報仇而持續尋找蛇埜目……

第5話【機密事項六二零 惟神】，雪村選擇與哥哥．健一同赴死。但健向她暗示淺陽的存在，並為了保護雪村而死。帶著淺陽逃出敵人老巢的雪村雖大仇得報卻也失去了哥哥，內心深受喪失感的折磨。此時得知自己懷孕的花風決心脫離組織。雪村被其勇於向未來邁進的身姿所打動，卻在隔天早上發現了她的屍體。

第6話【機密事項六二三 東雲】，讓雪村吞下的毒藥其實是令人陷入假死狀態的藥。淺陽想起了月城的建議，於是欺騙眾人，為了讓雪村逃脫而竭盡全力。此時慶喜召見仁，命他奪回月城帶走的新藥，並獻出擁有藍血，也就是新藥的製造材料的雪村。

故事背景設在明治 64 年，並由德川慶喜掌握權力的另一個日本。國家靠能量源「龍脈」，形成江戶和科學混合的獨特發展。但繁華背後，反體制派組織「蛇」正醞釀革命之火。德川政府委任闇組織「鵺」將其驅除。雪村咲羽在幼時被滅門，於是她作為「鵺」的處刑人，為報仇而持續尋找蛇埜目……